Em 2003 iniciaram-se as primeiras ações voltadas para o fortalecimento das atividades de aquicultura e pesca, destacando-se o apoio à estruturação das cadeias produtivas do camarão e do caranguejo no Delta do rio Parnaíba, bem como a realização de cursos de capacitação para técnicos da área de aquicultura.

Contemplado com grandes reservatórios, rios perenes e inúmeros pequenos e médios mananciais, o Piauí teve como prioritárias as ações de estruturação de suas principais estações de piscicultura: Adhemar Braga, em Piripiri; Deputada Francisca Trindade, no Povoado Nazária, em Teresina; e Estação de Porto Alegre do Piauí, no município de mesmo nome. Essas três ações representaram um incremento de mais de 100% na produção de alevinos pelo estado. Em paralelo, por meio de convênios com a Secretaria Estadual de Desenvolvimento Rural, foram capacitados dezenas de técnicos e piscicultores; fornecidos mais de 40.000 alevinos em reservatórios e tanques escavados para diversas regiões do estado; e distribuídos mais de 1.200 tanques-rede, com destaque para os produtores da Cooperativa Regional de Aquicultura de Picos - COAP, que hoje possuem mais de 400 dessas estruturas em operação na criação de peixes.

Em 2009, a Codevasf, em parceria com a Cooperativa Regional de Aquicultura de Picos (COAP), implantou a Unidade de Beneficiamento de Pescado no município de Bocaina-PI, com capacidade para processar cerca de 2.000 Kg de peixe/dia. A unidade será composta por área de recepção do pescado, processamento e frigorífico, e deverá receber a produção oriunda dos principais reservatórios situados em um raio de 250 km. As comunidades pesqueiras de barragens como Mesa de Pedra, em Valença; Jenipapo, em São João do Piauí; Petrônio Portela, em São Raimundo Nonato, entre outras, poderão encaminhar seu pescado àquela unidade, agregando valor ao produto e melhorando a renda de suas famílias.

Na região do Baixo Parnaíba, vem sendo apoiada a estruturação do Pólo Aquícola da Região de Parnaíba, com destaque para a construção da Unidade de Piscicultura de Parnaíba, viabilizado pela parceria da Codevasf com a Secretaria Especial de Aquicultura e Pesca – SEAP/PR, atual Ministério da Pesca e Aquicultura – MPA e Prefeitura Municipal de Parnaíba-PI; reforma do entreposto pesqueiro de Parnaíba e apoio aos catadores de caranguejo do Delta do Parnaíba. Nos últimos anos, a Codevasf, juntamente com o Governo do Estado do Piauí e Embrapa tem investido na estruturação do Centro de Referência em Aquicultura e Pesca do Vale do Parnaíba - CERAQUA-PHB, no município de Parnaíba-PI, para desenvolver estudos com espécies estuarinas e marinhas.

O CERAQUA-PHB, empreendido  na localidade Pedra do Sal, é resultado de uma parceria entre o Ministério da Pesca, Governo do Estado do Piauí, Codevasf e Embrapa Meio-Norte. O Centro destaca-se por ser um núcleo de Referência em Aquicultura e Recursos Pesqueiros do vale do rio Parnaíba, no que terá fundamental importância para o desenvolvimento de atividades de pesquisa, transferência de tecnologia, produção e extensão em aquicultura e gestão de recursos pesqueiros no contexto dos vales do Parnaíba (PI). O centro dispõe de laboratórios especializados na realização de pesquisas e produção nas áreas de aquicultura, recursos pesqueiros, nutrição, bromatologia, ictiopatologia, genética, limnologia e biotecnologia, contando ainda com estruturas de apoio, como alojamento para pesquisadores e visitantes, refeitório, auditório, salas de treinamento e viveiros para produção e pesquisa.